Consiste en elegir aquellos embriones de determinado sexo para evitar enfermedades de transmisión hereditaria. Se utiliza en caso de que los padres sean portadores de una enfermedad ligada al sexo que, por tanto, sería transmisible a la descendencia solamente si ésta hereda el cromosoma sexual afectado, X o Y. Así pues, se elige solamente aquellos embriones que no dispongan del cromosoma afectado. Por ejemplo, si es una enfermedad del cromosoma Y, escogeríamos para la transferencia únicamente embriones XX, es decir, niñas.
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